1、已有众多的文献报道，脂质体本身会参与细胞生理活动,引起基因表达的上调或下调。如参与PKC（蛋白激酶C）通路调节; 如抑制ATP酶的活性
2、如与线粒体膜发生作用; 转染siRNA造成脱靶效应等等。
3、细胞毒性的大小往往意味着对细胞生理活动影响的大小，脂质体这些作用是造成细胞毒性的根本原因。这会对相关研究数据产生严重的干扰，甚至影响研究的结论。这已引起了许多研究者的注意。
1、虽然人们早已发现脂质体对细胞的毒性，对研究的影响，但由于一直没有更好的方法尤其是更高效的转染方法代替脂质体，所以脂质体转染试剂一度应用非常广泛。同时，人们也一直在寻找更有效、毒性小同时对研究影响也小的转染试剂。
2、由于脂质类转染试剂对细胞的毒性是由其脂质特性决定的，目前众多的研究者和生物公司将新一代转染试剂的开发聚焦在非脂质体的聚合物上，并已有一些优秀的试剂产品上市，如Entranster试剂。
