1、在将上述基因序列保存好了之后，开始构建基因进化树。首先在网上寻找到MEGA6.0的软件，并将其下载下来，如图所示文件夹。
2、打开MEGA6的文件夹，找到MEGA6.06 exe，运行软件，弹出如图所示。
3、点击表头的Align，点击edit/Build Alignment,弹出如下对话框。点击ok。
4、完成上述步骤后，弹出如下对话框，选择DNA，弹出如下对话框。
5、接着对下面对话框的表头那一排，点击edit，点击Insert Sequence From File，弹出如下对话框，
6、将你之间准备好的基因序列单独建一个文件夹，在上一步完成后，将文件夹打开进去，会发现是空的，这时候需要你把文件类型改成txt格式，就能显示你的序列文档了。
7、将文件夹里面的基因序列文档全部选中，点击打开。如图所示。这时候你点击序列查看一下序列首尾两端是否对齐，如果出现载体没连接的情况，首位段序列不对齐，就可以把不对齐的序列去掉。去掉方法，选中序列某一段，点击X就行了。
8、可将前面的序列名称改一下，等下好构建基因计划树。改好后如图所示：
9、接着点击表头的W，将序列点击一下（选中序列），点击Align DNA，点击ok，结束后如图所示。
10、点击Data，点击Phylogenetic Analysis，弹出如下所示对话框，点击yes，结束后返回到第一个界面。如图所示。
11、点击Analysis，点击Phylogeny，点击Construct/Test Neighbor-Joining Tree。。。弹出如下对话框，然后点击yes，
12、点击Compute,弹出如下基因进化树比对结果。点击Image，点击Copy to clipboard，即可将图片复制粘贴到WPS文档。
