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蛋白棉不能长期放在鱼缸里。通常在有黄水的时候，才需要往缸中放蛋白棉，等到吸收饱和后，亟冁雇乏需要取出并放到高浓度的盐水中浸泡一天，再用清水浸泡一天稀释。需要注意的是，这种东西不用的时候一定不能晾干，而要带水保存，更不可以高温处理，不然就会失去效用。
蛋白棉净水的原理：
蛋白棉用于水族的净水通常是处理鱼缸的黄水，这是利用其吸附作用，也是一种交换反应。蛋白棉里的离子通过交换水中固体离子，同时释放一个等价弱碱性OH⁻离子出来。当然，同时也能吸附水中杂散离子，从而达到净化水的目的。
既然是交换的过程，那么，很明显，蛋白棉在去除黄水的同时，极有可能会将水中酸分子吸附，交换酸性离子释放碱性离子，结果就肯定会导致水体PH值的改变！我们常说的跌酸也就是这个原理，因此，在使用蛋白棉净水的时候我们需要谨慎，否则虽然水是变清了，但是水的酸碱度激烈动荡造成的水质变化，进而导致水里生物产生健康问题就得不偿失了。
