一、性质上的不同：
9月份的科目余额表是基本会计作账表格，是各科目结余情况.把这表的余额填在资产负债表上和损益表上，就出了报表。
导出的1-9月份科目余额表是科目余额明细表在资产负债表里反映的是至本月末各资产负债的金额，在各明细分类帐中反应的是各明细帐户至本月末的最新金额。
二、制作方法不同。
科目余额明细表制作所有已制单的单据（凭证）的余额，原理为期初余额+（或-）本期发生额（包括借方发生额和贷方发生额）=期末余额；只是在选项时有无包括已记帐凭证，就是范围，一般应选择包括未记帐的凭证。
而制作科目余额表需要各个科目的余额，一般包括上期余额,本期发生额,期末余额等。通俗点说就是跟据汇总的凭证而形成的每个科目的余额，而这些科目分属于资产、负债和所有者权益，所形成的等式就是资产=负债+所有者权益。
三、制作的时间不同。
科目余额明细表在年末制作，而科目余额表在年初制作。
