1、商业企业可以分为综合性的大型超市，专门性的超市，批发企业和零售企业。商业企业的管理模式不同，涉及到税务检查方法是不一样。一个商业企业，一定要搞清它的属类、规模、组织机构和管理模式、业务流程、合作方式以及营销模式。做好充分的准备是必不可少的。
3、商业企业的常采用稽查方法有：查发票方法。有部分企业由于要虚列成本，一般会采取假发票列支费用。可以选取顾疫挚渝金额较大的普通发票去网站上验证真伪。对于增值税专用发票可以核实其“三流”（资金流、货物流、资金流）。查往来科目法。是否有余款未付完。是否有长期挂应付款项等。查广告宣传费。了解企业采取的宣传措施。是否存在以货易货，将产品用于广告，是否存在馈赠未视同销售等。要仔细审查销售政策中的业务政策与税收政策的相关性。信息流程法。像超市类的商业企业都运用了信息系统，一个业务流程就对应有一个数据流程，将整个流程中的若干环节数据相比对，往往能够发现大问题。例如说，查询发货系统里面的数据，对比销售系统里面的数据往往能对比出问题。
