GEO数据库中某一疾病的差异基因分析(二)

 时间:2025-01-04 20:31:15

1、1 GEO数据检索

2、1.1搜索基因云馆分析平台 ,登录系统(或注册后登录),见PIC.1

GEO数据库中某一疾病的差异基因分析(二)

4、GSE75037检索结果是这样的,见PIC.3

GEO数据库中某一疾病的差异基因分析(二)

7、2.2找分组信息 找对分组信息是关键,打开第一步GEO数据检索结果里面的GSE75037_GPL6884pData.csv文件,见图PIC.5。很明显I列信息就是要找的分组信息,列名称source_name_ch1就是芯片数据预处理的groupName,另外,可以看出该数据只有两个分组,即Non-malignant lung和Lung cancer。

GEO数据库中某一疾病的差异基因分析(二)

9、芯片数据预处理后,结果是这样的,见 PIC.7

GEO数据库中某一疾病的差异基因分析(二)

11、结果是这样的,见PIC.9和PIC.10

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