根据基因ID号批量下载基因的cDNA序列

 时间:2024-10-13 08:26:37

1、将图中的perl代码编辑为perl程序,不会的去问度娘。

根据基因ID号批量下载基因的cDNA序列

2、编辑好的程序如图,是这么一个图标,这么一个格式(pl)

根据基因ID号批量下载基因的cDNA序列

3、准备你需要下载的基因ID,把ID号写入一个文本文档,每行一个ID号,以玉米基因序列下载为例。

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4、准备一个fasta格式的玉米序列库,你可以根据自己的需要准备相应的数据库。将这三者(ID、序列库、pl程序放到D盘的同一个文件夹内,文件夹标记为1)

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5、调动cmd,以此键入“cd..” (回车); “cd..” (回车); “cd 1”(回车);“dir”(回车)如下图,出禊耗髻编现D盘文件夹1的内容。然后输入“perl 4.pl 3.fasta 1.txt >seq1.txt”。输入完之后回车运行即可。

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6、打开文件夹1,你会发现多了一个文件——seq1.txt.

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7、打开这个txt,即为下载的序列

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