1、科属不同。花椒是芸香科(学名：Rutaceae)是被子植物亚门、双子蒺玫照秘叶植物纲、无患子目的一个科；胡椒（学名：Piper nigrum L）是胡椒科，直立或蔓生草本、灌木、稀乔木。
3、叶子不同。花椒的叶子呈卵形或椭圆形，没有叶柄，叶子边缘有细裂齿；胡椒叶子长圆形，有叶柄，叶子的顶端短且尖，基部呈圆形。
5、口感不同。花椒的香味浓烈、有麻味，而胡椒的口感是香中带辣；花椒一般食用果皮，而胡椒吃的是内果，外壳是不能吃的。
7、功效不同。花椒具有去膻除腥的功效，非常适合肉类烹调使用，花椒还能起到降低血压的作用；胡椒作为增香剂，可以为菜品提鲜增香，令汤汁更加鲜美，同时有一定的养胃滋补的功效，还能缓解鼻塞。
