用Past软件做主成分分析(PCA)

1、Past数据导入及样品分组方法见百度经验《Past统计分析软件数据导入及分组方法》，最终得到如图所示的数据形式。

首先Ctrl+A全选数据

2、Multivariate菜单--Ordination--Principle Components (PCA)

3、Summary选项卡列出了每个坐标轴的Eigenvalue值及其所占百分比。

如果修改了运行参数，需要点击Recompute重新计算

4、Scatter Plot选项卡给出了PCA图，右边有若干选项（例如是否显示样品标签）

点击“Graph Setting”按钮可设置更多作图选项

5、如图可增加图片的外边框，将坐标轴由中间位置改为在边框上。

可选择多种图片格式(SVG是矢量图，最清晰)，点击Picture按钮可保存图片。

6、Scores选项卡显示样品点在PCA图上的坐标，点击Copy复制全部内容，可粘贴到excel中。