1、使胚胎移植具有选择性。经过比鲜胚更长的体外培养时间，能够进一步的淘汰有缺陷、无发育潜能的胚胎，达到优胜劣汰的目的。
2、更符合生理着床时间。因为囊胚需要比鲜胚培育更长时间，所以能够与子宫内膜得到同步，这样能够提高临床妊娠率和胚胎种植率。而在拥有优质囊胚的情况下，可以只进行单囊胚移植，降低多胎妊娠率。
3、保证植入的成功率。因为囊胚经过去透明带，能够直接附于子宫膜。
4、降低胚胎和母体联系时收到的不良因素影响。而囊胚移植能够通过缩短种植于胚胎继续发育的时间，达到降低不良因素的影响。
1、囊胚培养要求条件高，由于实验室培养条件或胚胎自身原因，胚胎可能会停止发育或退化，导致没有胚胎可移植。
2、不能浪费较多的卵裂期胚胎：由于体外培养环境终究不是体内自然环境，延长培养时间，可能使一部分能够着床的卵裂期胚胎退化。
1、如染色体异常患者等需要做胚胎活检的患者，在完成活检后，进行囊胚培养的同时等待PGD结果。
2、因为某些原因而需要暂缓胚胎移植，但是依然希望能够移植新鲜胚胎的患者，就可以利用培养囊胚的时间进行缓冲。
3、胚胎质量较好却因为不明原因移植失败，怀疑胚胎发育潜能受限。
4、预计可以成功培养出囊胚，为了优化胚胎选择，减少同时移植胚胎的数目。
