利用HMM，jalview找基因家族

1、首先，拿到所需要参考基因的蛋白质序列，然后将序列导入jalview，进行比对，如图（刚把序列放进去的时候，alignment可能是灰色的，稍安勿躁，软件可能需要反应一会儿）。

3、再随后将stk文件改为sto文件，并将该文件拖入hmmer文件夹下，即

5、然后我们就可以比对啦~我们将hmm文件在要找的物种的蛋白序列中进行比对，如图