如何作出满意的热图(heatmap)

 时间:2024-10-27 12:41:47

1、方法/步骤11、搜索平台基因云馆,登录系统(或注册后登录)。

如何作出满意的热图(heatmap)

3、结果是酱紫的:

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5、其中,groups就是我们的分组。这很重要,分组信息是否正确往往决定了我们能否做出好的分析结果。通过差异基因分析,可以得到差异基因的表达谱信息,在DEGexp.csv,具体信息:

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7、方法/步骤21、热图(heatmap)绘制在table处输入需要输入绘图的csv文件,这里为DEGexp.csv;在pdata处输入样本数据分组信息pDatamatrix.csv;colselect处,分组依据参考pDatamatrix.csv文件,填“groups”;需要对基因数据聚类则在RowCluster处选TRUE,需要对样本数据聚类则在ColCluster处选TRUE,其他的按照默认值,就是这样的:

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9、点heatmap.html得到下面的样子:

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11、点击运行运行结束后,结果:

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13、(tip:通过修改pDatamatrix.csv文件中的列“groups”,热图中分组标签上的信息是可以随心改动的)并重新上传pDatamatrix.csv文件,按照需求设置好参数,点击运行运行结束后,结果:

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